Futó projektek:
GENOMIKAI NTPGENOMIKAI NTP
(2009-2010)
Támogatja:
Partner honlapunk:



Szegedi Tudományegyetem

Orvosi Genetikai Intézet

Az SZTE ÁOK Orvosi Genetikai Intézet (Onkoterápiás Klinikával közösen felszerelt) Molekuláris Genetikai Laboratóriumában történnek a genetikai fejlődési rendellenességek megelőzésére, a női és férfi meddőség, reprodukciós sikertelenség, daganatos betegségek, hypertonia valamint a vele járó cardiovasculáris betegségek, és a vérzékenység génszintű kivizsgálásai, a fenti populációkat jellemző génpolimorfizmusok felmérésére szolgáló genetikai vizsgálatok.

Ma már teljesen elfogadott az a nézet, hogy e betegségek a gének és a környezeti tényezők együttes hatásának következményeként alakulnak ki. A cardiovascularis és a daganatos betegségek a populációnak egyre nagyobb részét érintik. A genetikai polimorfizmus részletesebb elemzése adhat magyarázatot arra, hogy egyes emberek kevésbé, míg mások könnyebben fogékonyak e betegségek kifejlődésére. Ugyanez a tény befolyásolhatja a genetikai habitusnak megfelelő helyes gyógyszerválasztást is. A népbetegségnek számító betegségek eseteiben (pl: hypertonia, atherosclerosis, hyperlipidemia, myocardialis infarctus, stroke, 2 tipusú diabetes mellitus, terhességi toxaemia) keressük azokat a tényezőket amelyek a betegség kialakulásának kockázatát növelik. E betegségekben a renin-angiotenzin rendszer (RAS) elemeinek és a methylen terahydrofolat reductase (MTHFR) polimorfizmusa döntő szerepet játszik ezért elemezzük az ACE gén inszerciós/deléciós allélváltozatait az angiotenzinogén gén M235T aminosavcseréjét valamint az angiotenzin II 1-es típusú receptor gén A1166C polimorfizmusát. E gén-polimorfizmusokra vonatkozó nemzetközi populációs vizsgálatok egymásnak ellentmondó adatai miatt szükséges a magyar lakosság esetében is e gének feltérképezése, a frekvencia gyakoriság vizsgálata, mert csak a pontos genetikai diagnózis teszi lehetővé a terápia finomítását, hatásosságának növelését illetve a megelőzés lehetőségeinek a kidolgozását. A funkcionális genomika keretein belül keressük arra a kérdésre a választ hogy milyen összefüggést találunk az MTHFR és a RAS rendszert kódoló gén polimorfizmusai az életmód és a fenti betegségek súlyossága között.

Az itt végzett molekuláris genetikai vizsgálatok további célja a metilén terahidrofolát reduktáz gén (MTHFR) C677T mutációjának a populáció genetikai vizsgálata, illetve kóros humán reprodukcióban játszott szerepének megállapítása mind a férfi és női meddőség eseteiben, mind a veleszületett fejlődési rendellenességek több típusánál (pl.: velőcső záródási rendellenességek: anencephalia, spina bifida, conotruncalis szívfejlődési rendellenességek, valamint végtagfejlődési rendellenességek). Az emberi betegségek kialakulásában feltehetően jelentős szerepe van az MTHFR génpolimorfizmusnak , ezért a cardiovascularis és a daganatos betegségekben is vizsgáljuk a különböző allél gyakoriságokat.

A morbiditási és mortalitási mutatók alapján a hypertoniával járó (cardiovascularis) betegségek hazánkban a vezető helyen állnak. E betegségek genetikai hátterének felderítése, genetikai mintatár létrehozása, elemzése illetve a polimorfizmust figyelembe vevő betegség specifikus, populációszűrést és megelőzést biztosító diagnosztikus eljárások és az ezeken alapuló gyógykezelés kifejlesztése nemzeti érdek.A betegségek genetikai hátterének vizsgálatával egyidejűleg a pharmacogenomika (genotipusnak megfelelő gyógyszer kiválasztása) gyakorlati elveinek kidolgozásán is dolgozunk.

Az V-ös véralvadási faktor gén Leiden mutációjának kimutatása a populációgenetikai elemzések alapján lehetővé teszi a korszerű fogamzásgátló tanácsadás kidolgozását, valamint a genetikailag magas kockázatú családokban a thrombosis és annak súlyos szövődményei, mint embolia következtében létrejövő katasztrófa megelőzését. A trombosisra való hajlam kiderítésére további molekuláris genetikai vizsgálati lehetőség áll a rendelkezésünkre. A prothrombin gén molekuláris analízise a génben bekövetkezett G20210A pontmutáció polimorfizmusáról ad felvilágosítást. A daganatos betegségek eseteiben feltételezzük, hogy a tumorválaszt a beteg genomikai adottságai jelentősen meghatározzák. A timidil szintetáz gén genotípus meghatározása egy lehetséges eszköz a kemoterápiás kezelés individuális kialakításában. Vizsgálatunk célja az, hogy értékeljük a kis dózisú kemoterápia (Tegafur, amely az 5-fluorouracil transzport formája) és a sugárterápia együttes alkalmazásának hatékonyságát és tolerálhatóságát a timidil szintetáz gén promoterpolimorfizmusának tükrében az 5FURA-val kezelt különböző daganattípusokban.

Molekuláris genetika:

Genomika:

A molekuláris genetika hozzáférhető vizsgálatai:

- Methylentetrahydrofolat reductase (MTHFR) C677T pontmutáció vizsgálata Prof. Dr. Szabó János
- Leiden mutáció: az V. factor gén 10. exon G1691A pontmutáció vizsgálata
- Prothrombin G21210A mutáció vizsgálata
- Haemochromatosis C282Y mutáció vizsgálat allélspecificus amplifikációval
- Angotenzin Converetáló Enzim (ACE) I/D polimorfizmus analízise,
- az angiotensinogén enzim M235T aminosavcsere, valamint
- az AT1 receptor gén A1166C mutációjának vizsgálata
- A 13-as,18-as, 21-es, és az X, és Y kromoszóma aneuploidia valamint a mikrodeléciós szindrómák detektálása FISH technikával
- Y kromoszóma mikrodeléció analízis
- Timidilát szintetáz génpolimorfizmus detektálása PCR-ral
- Thiopurin S metiltranszferáz génpolimorfizmus detektálása PCR-ral
- Connexin 7 és 26 –os fehérjéket kódoló gének mutáció analízise
- BCR-ABL, CBFB-MYH, AML1-ETO génexpressziók monitorozása myeloproliferatív kórképekben valamint minimális residuális betegségekben

Témák:

A genetikai betegségek és fejlődési rendellenességek (spina bifida, szív- és végtagfejlődési rendellenességek) megelőzésére, a női és férfi meddőség, reprodukciós sikertelenség, a hypertonia és a vérzékenység oki kivizsgálására valamint a populációt jellemző adott génpolimorfizmusok analízise.

A hypertonia és a terhességi toxaemia. A hypertonia, a metabolikus X szindroma és a 2-es tipusú diabetes mellitus molekuláris genetikai hátterének vizsgálata.

A reprodukciós genetika keretein belül a férfi infertilitás genetikai hátterének a vizsgálata történik különös tekintettel az Y kromoszóma mikrodelécióira az azoo- és oligospermiás férfiakon a Szülészeti és Nőgyógyászati Klinikával kollaborációban

A tumorgenomika területén az Onkoterápiás Klinikával közösen a timidilát szintetáz génpolimorfizmus vizsgálat történik annak érdekében, hogy információt szolgáltassunk az 5FURA kezelés várható hatékonyságáról, valamint a mercaptopurin sejten belüli koncentrációjáról és annak hatásáról. A project pharmacogenomikai vonatkozású.

A süketség genetikai hátterének vizsgálata:

A GJB-2 gén kódolja azt a Connexin 26 gap juction fehérjét amely funkciójának elvesztése a nem szindrómás süketséghez vezet. A GJB-2 génpolimorfizmus vizsgálat a Fül Orr Gége Klinika munkatársáival kollaborációban történik.

Myeloproliferatív kórképek genetikai hátterének kivizsgálása valamint a minimális residuális betegségek monitorozása a bcr-abl, az aml1-eto valamint a cbfb-myh fúziós transzkriptumok expressziójának detektálása során.

A molekuláris genetika fejlesztés alatt álló témái:

- Fragilis X szindróma molekuláris genetikai kivizsgálása PCR technikával

A genomika hozzáférhető vizsgálatai:

- Az 1-es pontban megjelölt génpolimorphizmusokhoz tartozó funkciók vizsgálata.

A genomika fejlesztés alatt álló témái:

Cardiovascularis betegségek molekuláris genetikai vizsgálata

A cardiovascularis megbetegedések száma hazánkban egyre növekszik. Felismerésükre és kezelésükre későn kerül sor. A késői stádiumban végzett kezelés költségei ugrásszerűen emelkednek, tovább növelve az amúgy is nagy gazdasági terheket. A gazdasági elemzések azt mutatják, hogy a betegségek megelőzése jóval olcsóbb, ezért a prevenciós technológiák megvalósítására kell törekednünk.

Ma már teljesen elfogadott az a nézet, mely szerint e betegségek a gének és a környezeti tényezők együttes hatásának következményeként alakulnak ki. Az iker és családi tanulmányok a családtagok vérnyomás értékei közötti korreláció felfedésével például rámutattak arra, hogy az esszenciális hypertonia kialakulásáért a genetikai hajlam legalább 30%-ban tehető felelőssé. A monogénes betegségekkel szemben, itt több gén együttes hatása érvényesül, kiegészülve a környezeti tényezők (pl.: helytelen táplálkozás) negatív hatásával. A cardiovascularis betegségek a populációnak egyre nagyobb részét érintik. A genetikai polimorfizmus részletesebb elemzése ad magyarázatot arra, hogy egyes emberek kevésbé, míg mások könnyebben fogékonyak e betegségek kifejlődésére. Ugyanez a tény befolyásolja a genetikai habitusnak megfelelő helyes gyógyszerválasztást is, amely ma még nem gyakorlat. A hypertonia számos betegség (atherosclerosis, hyperlipidemia, myocardialis infarctus, stroke, 2 tipusú diabetes mellitus, terhességi toxaemia, stb.) velejárója. E betegségekben a renin-angiotenzin rendszer (RAS) elemeinek és a methylen terahydrofolat reductase (MTHFR) polimorfizmusa döntő szerepet játszik. E gén-polimorfizmusokra vonatkozó nemzetközi populációs vizsgálatok egymásnak ellentmondó adatai miatt szükséges a magyar lakosság esetében is e gének feltérképezése, a frekvencia gyakoriság vizsgálata, mert csak a pontos genetikai diagnózis teszi lehetővé a terápia finomítását, hatásosságának növelését illetve a megelőzés lehetőségeinek a kidolgozását.

A timidil szintetáz gén promoterpolimorfizmus vizsgálata kis dózisú 5-fluorouracil kemoterápiával és sugárterápiával kezelt előrehaladott stádiumú fej-nyak rákos betegeken

A timidil szintetáz az egyik kulcsfontosságú target a kemoterápia számára így a génpolimorfizmus, valamint a génexpressziós vizsgálatok fontos információt jelentenek a kemoterápia hatékonyságának előrejelzésében.

Ismeretes, hogy a TS gén promoter régiójában polimorf tandem repeat szekvencia van, amely befolyásolja a timidil szintetáz gén expresszióját . A polimorf allélokban kettő (2 Repeat) vagy három (3 Repeat) 28 bázispárból álló ismétlődő szekvenciát különböztetünk meg. A 3R genotípus asszociált a magasabb TS expresszióval, míg a kettő 28 bp hosszú fragment jelenléte alacsonyabb TS expresszióra utal.
Mivel a TS expresszió befolyásolja a kemoterápiás kezelés hatékonyságát, valamint a drog okozta toxicitást vagy mindkettőt a tandem repeat promoterpolimorfizmus vizsgálat, információt szolgáltathat a sejtek basális TS szintjéről, ami segítségül szolgálhat a kemoterápiára adott válasz előrejelzésére.
Célkitűzésünk volt annak vizsgálata, hogy a fej nyak tumoros betegek TS gén promoter polimorfizmusa jelzi-e, illetve milyen mértékben jelzi az 5- fluorouracil (FURA) alapú kemoterápiára adott válaszreakciót. A timidil szintetáz gén genotípus meghatározása egy lehetséges eszköz a kemoterápiás kezelés individuális kialakításában.

<<vissza