Debreceni Egyetem

Debreceni Klinikai Genomika Központ

Központi szolgáltató és kutató laboratórium, a Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet alegysége (Debreceni Egyetem Orvos- és Egészségtudományi Centrum). A Debreceni Egyetem Orvos- és Egészségtudományi Centruma létrehozta a Debreceni Klinikai Genomikai Központot (DKGK) abból a célból, hogy lehetőséget biztosítson a Debreceni Egyetemen működő munkacsoportoknak és külső kollaborációs partnereknek nagy áteresztőképességű genomikai módszerek és bioinformatikai szolgáltatások használatára. Különös figyelmet fordít a DE OEC arra, hogy elősegítse klinikai genomikai vizsgálatok létrejöttét betegségek pathomechanizmusának illetve potenciális gyógyszercélpontok kutatására.

A molekuláris genetika hozzáférhető vizsgálatai:

- Real time quantitative PCR mérések magreceptorok (PPAR, RAR, RXR, LXR) és ezek célgénjeinek mérésére Nagy László, Szatmári István

A molekuláris genetika fejlesztés alatt álló témái:

- Szteroid hormonreceptorok SNP analízise kóros lipidanyagcsere eseteiben Nagy László
- Gyermekkori Akut Limphoid Leukémia kórlefolyásának követése TEL-AML1 kromoszóma-transzlokáció és Ig/TCR génátrendeződések kvantitatív detektálásával (Együttműködés DE OEC Gyermekklinikával) Scholtz Beáta
- SNP analízis nukleáris hormonreceptorokra (PPAR gamma, alpha, delta, LXR alpha, beta) lipidanyagcsere zavarokban (együttműködés a DE OEC I Belklinikával Prof Paragh) Nagy László
- "thero-panel" kialakítása olyan gének szintjének mérésére perifériás monocitákból és atheroszklerotikus léziókból, melyek szerepet játszhatnak az érelmeszesedés kialakulásában (együttműködés a DE OEC I. Belklinikával Dr Balla) Nagy László

A genomika hozzáférhető vizsgálatai:

- Alveoláris makrofágok expressziós profiljának meghatározása krónikus obstruktiv tüdőbetegségből (COPD) (együttműködés Pfizer Global Research-csel és DE OEC Tüdőgyógyászati Klinikával) Nagy László, Scholtz Beáta
- Expressziós mintázatok (transzkriptóm) myeloid sejtek differenciálódása és magreceptorok aktiválása során (cDNS es Affymetrix array analysis) Nagy László, Szatmári István

A genomika fejlesztés alatt álló témái:

- 40K humán cDNS chip előállítása (együttműködés University of Texas-Houston, Medical School Genomics Core Laboratory-val és SZBK Chip Laborral) Scholtz Beáta, Nagy László
- Serial Expression of Gene Expression (SAGE) analízis génexpressziós mintázat meghatározására myeloid sejtekből Nagy László
- génexpresszió mintázat gyermekkori ALL-ban (DNS-chip) Scholtz Beáta

<<vissza